不要说严嵩及其同党，就是嘉靖皇帝也不会放过他。
按照嘉靖朝这时的政治生活逻辑，严嵩受宠信任，因此抨击他就是攻击皇上。
而且在奏章中，杨继盛还直接批评了皇上“甘受嵩欺，人言既不见信，虽上天示警，亦不省悟”;
“堕于术中而不觉”;
宁愿“百万苍生之涂炭”，也不忍心“割一贼臣”等，
这不就是直接说，嘉靖帝是一位贤、奸不辨的昏君吗?
有了固执己见、独断专行的嘉靖皇帝作为后台支持，严嵩击败杨继盛就有了坚实的保障。
七十三岁的严嵩，毕竟是在官场摸爬滚打多年的老狐狸。
对于杨继盛所列举的事实，他虽无法直接反驳，但仍能狡猾地找到“把柄”，以此将杨继盛置于死地。
老奸巨猾的严嵩，在杨继盛洋洋洒洒五千多字的奏章中，一眼就盯上了“皇上或问二王，令其面陈嵩恶”这句话，
并将它作为密谋构陷杨继盛罪名的法宝，而年轻气盛的杨继盛则“过于耿直而招来重罪”，偏偏在这个朝廷里最敏感的问题上不懂得变通和回避。
嘉靖皇帝有八个儿子。其中五个儿子早年夭折，只剩下次子朱载壑、三子朱载垕、四子朱载圳长大成人。
嘉靖十八年，立次子朱载壑为皇太子，封三子为裕王、四子为景王。
二十八年时太子去世，按照正常顺序，三子裕王应当继立为皇太子。
但皇帝在两位王子之间犹豫不决，这引发了二王争夺太子之位的明争暗斗。
同时，道士陶仲文又提出了“二龙不能相见”的说法，皇帝信以为真，于是命令两位王子住在宫外，不得面见圣上。
这种父子隔绝的状况，也加剧了皇帝的猜疑，生怕两位王子背着他有什么不轨之举。
如果杨继盛的上书与两位王子有关，那就是勾结亲王干预朝政，依法当斩；
即使没有直接关联，严嵩也可以为他编造罪名，那就是“诈传亲王令旨”，这在法律上同样是死罪。
因此，只要一提及“二王”，就一定能给皇帝带来强烈的刺激，引发极大的怀疑。
于是严嵩向皇帝指明杨继盛奏章的关键是“引用二王作为说辞”。
他的目的果然达到了。
正月二十，奏章呈上两天之后，皇帝就下达了圣旨：
“这家伙因为被贬官心怀怨恨，拾人牙慧，肆意妄为地上奏。奏章里引用二王作为说辞，究竟是何居心？命令锦衣卫将其逮捕送交镇抚司，狠狠地拷打审问清楚后再来汇报。”
杨继盛被投入监狱拷问。
用刑极其残酷。然而杨继盛坚强不屈，是个“铁骨铮铮的汉子”。
审讯官追问“指使他的人是谁”。
他回答说：“尽忠是我自己的事，难道一定要等人指使吗？如果有人敢指使，那他自己就会去做了，又何必让别人去做呢？”
审讯官又追问“他引用二王的原因”。
他回答说：“奸臣误国，虽然能欺骗皇上，但一定不能欺骗二王。”
“最亲近的莫过于父子，皇上如果问二王，他们一定会说出奸臣的过错。”
而且严嵩父子作恶多端，“除了二王，还有谁敢不惧怕严嵩呢？又有谁敢说出他的过错呢？”
审讯官一无所获，在拶指、敲杖、夹棍等各种刑罚都用过之后，给他钉上肘镣送进了监狱。
到了二十二日，皇帝又下了圣旨，命令锦衣卫再打他一百棍，然后转送刑部监狱，从重治罪。
嘉靖命令刑部给杨继盛定罪。
刑部尚书何鳌是严嵩的门生，侍郎王学益是严世蕃的儿女亲家，他们遵照严嵩父子的意旨，拟定了“诈传亲王令旨”的罪名，按照《大明律》的规定，此罪应处以绞刑。
刑部郎中史朝宾刚正不阿，坚决反对，他驳斥说：
“没有这件事却硬拉扯在一起，以此来判人死刑，作为臣子阿谀奉承而侮辱国家法律，怎么能这样呢？”
但是何鳌、王学益强行定稿，命令他署名签字。
杨继盛虽然被打入死牢，但仍然泰然自若，读书不止。身陷囹圄之中，他仍然挂念着百姓的穷苦，上书给内阁次相徐阶，陈述自己对救灾的看法。
在朝审的路上，他戴着刑具长板扭镣，“围观的人像一堵墙一样，多到连路都走不通”。
杨继盛深受感动和鼓舞，吟诗道：
“风吹着枷锁满城飘香，人们簇拥着争看这位员外郎。哪愿一同被称为义士，只是可怜戴着长板镣铐去见君王。……生性怪癖生来就不怕死，这身体原本就不会像杨朱那样逃避。”
杨继盛被判死刑后，皇帝命令暂时监禁等候处决，并没有立即执行。
三十二年九月、三十三年九月两次朝审时，吏部都以“按照法律，案情属实”，奏请执行死刑，但皇帝再次犹豫不决，仍然命令暂时监禁。
到了三十四年五月，总督南直隶、浙江、福建军务的张经、浙江巡抚李天宠被严嵩的义子赵文华诬陷，以“玩忽职守、祸害百姓”的罪名判处死刑投入监狱。
严世蕃知道，皇帝对军务失职的边疆大臣一定会严惩不贷，因此在本年秋审死囚时，就将杨继盛的名字附在张经、李天宠案件的末尾，一起上报。
皇帝下令，“依法处决”，立即执行。
嘉靖三十四年十月二十九日，杨继盛在市集中被斩首。
终年四十岁。临刑前，他意志坚定，声音悠长地长啸，吟诵着流传千古的绝句而死：
浩气还太虚，丹心照万古。生前未了事，留与后人补。
…………
祁东楼收回回忆打断眼前李进的背诵：
“那你可知道杨继盛的下场？”
“大不了一死，到下边与杨公等着严家父子。”
祁东楼微微摇头，脑海里过目不忘的本领浮现出一段文字。
“你把死想的太简单了，先不说你会不会连累你的家人，你犯了这样的事，是能轻易一死了之？”
祁东楼敲了敲木椅的扶手，继续说：
“你只读过杨继盛这篇弹奏的奏疏，不知道杨继盛临死前遭受过什么，我来给你讲解他狱中撰写的《自著年谱》、《遗嘱》里的遭遇。”
“杖死醒后，臀肉尽脱，股筋断落，脓血续涌，不亡如缕。”
“又日夜笼匣，身关三木(笼匣、三木皆刑具)，痛不得抚，痹不得摇。”
“昼不见日，夜不见星，药饵断绝，饮食沮抑，从古被逮之苦未有如此之烈者。”
受打之先，王之诰送螂蛇胆一块(服之可以御杖止痛)，予曰：“椒山(杨继盛号椒山)自有胆。何必螂蛇哉!”
杨继盛言“岂有怕打杨椒山者!”遂谈笑赴堂受打。
予两腿肿粗，相摩若一，不能前后；肿硬若木，不能屈伸，死而复苏。
此疮溃已深，非瓦尖所能到也，遂以小刀割之。
先用针线将腿皮穿透，提起，将刀刺入，约一寸深，周围割一孔，如钱大，脓血流出。
方予割肉时，狱卒持灯，手战，至将坠地，曰：“关公割肉疗毒，犹借于人，不似老爹自割者”!
自初疮至愈，脓岂止六七十碗而已哉!
随着祁东楼一字一句的说出，李进刚才愤慨的脸上微微变得冷清了下来，面部有些抽动，但是目光依然坚定。
