得到批准后，李秀成立即返回浦口安排好防务，然后迅速赶往芜湖，召集了皖南各路太平军将领召开军事会议。在会上，他详细分析了当前形势，指出清军主力集中在金陵（南京），而其后勤补给主要依赖于苏杭一带。因此，如果能够成功攻占杭州，不仅可以直接威胁到清军的物资供应线，还可能迫使他们不得不从金陵抽调兵力前往救援，进而为天京解围创造机会。
按照这一计划，正月间，李秀成率领七千精兵从南陵出发，经宣城一路向杭州挺进。途中，他连续攻克了广德、安吉、长兴等重要据点，与此同时，他的堂弟李世贤也在湖州附近发动攻势，以此吸引清军注意力。当李秀成率六千精锐突然出现在杭州城下时，当地的官绅完全没有准备，很快便放弃了抵抗，杭州落入太平军之手。
得知杭州失陷的消息后，江南大营统帅和春果然如李秀成所料，急忙命令总兵张玉良和浙江提督郑魁士分别从金陵和宜兴两地发兵援救杭州。据统计，为了应对这次危机，江南大营共调动了一万三千多名精锐部队，这无疑极大地削弱了其守卫金陵的能力。
见清军中计，李秀成并没有急于占领杭州，而是巧妙地利用疑兵之计，在城头插满旗帜制造假象，使张玉良误以为杭州仍有大量守军驻扎。随后，李秀成带领主力部队悄然撤出，取道余杭、临安直奔苏皖交界的建平。在这里，他又召开了另一场重要的军事会议，与会者包括李世贤、杨辅清、陈坤书、黄文金等多位高级将领。经过讨论，大家一致同意由李秀成亲自指挥从溧阳、句容方向进攻淳化镇及紫金山一带；同时，陈玉成将从全椒南下，目标是江陵镇附近的板桥和善桥。此外，其他各路人马也将根据各自的实际情况配合主攻部队行动。
三月份，随着预定时间的到来，各路太平军开始对江南大营发起猛烈攻击。天京城内的守军也趁机出击，形成了内外夹击之势。在这场激烈的战斗中，太平军共摧毁了五十多座清军营垒，数万名清军士兵被迫溃散。和春等清军高层官员甚至来不及穿戴整齐就仓皇逃往镇江。至此，第二次破江南大营的战役取得了圆满成功，天京之围也随之解除。这场被称为“围魏救赵”的经典战例充分展示了李秀成卓越的战略眼光和指挥才能。
八、克复苏浙
1860年四月，在第二次攻破江南大营之后，洪秀全在天京召开了高级将领会议。在这次会议上，李秀成积极支持了洪仁玕提出的东征苏杭的战略计划，旨在先夺取富庶的江南地区，然后再西进攻击武汉。这一战略不仅能够为太平天国带来急需的经济资源，还能进一步扩大其控制范围。
担任东征主将的李秀成随即率军展开了一系列军事行动。他首先攻克了丹阳、常州和无锡等重要城市，最终成功占领了苏州。清军在苏州失陷后被迫向杭州方向溃退，而李秀成则紧随其后，一路追击并收复了浙江嘉兴。这些胜利极大地扩展了太平天国在东南地区的影响力，并为其后续的发展奠定了基础。
占领苏州后，李秀成采取了一系列措施来安抚当地百姓。他亲自下乡劝说民众，并通过出示招抚政策等方式迅速稳定了局势。随后，他在苏南建立了苏福省，将其打造成了太平天国的一个新的重要基地。在此过程中，李秀成还注意到了当地农民所面临的沉重赋税问题。他将民众的困境如实上报给洪秀全，后者随即下令减轻田赋负担。此外，李秀成还在苏南推行“着佃征粮”政策，允许农民领取“田凭”，从而将租种的土地视为自己的产业。这项改革极大地激发了农民的积极性，使得该地区的农业生产得到了显着恢复和发展。
除了农业方面的改革，李秀成还积极推动工商业的发展。他鼓励经商活动，并提供资金支持给那些缺乏启动资金的人们。这种做法不仅促进了当地的经济繁荣，也吸引了大量流民前来定居。据记载，当时的苏州呈现出一片欣欣向荣的景象，市场上货物充足，人口密集，甚至比战乱前还要繁华。
然而，正当太平军在苏常战场取得一系列胜利之时，湘军却加紧了对安庆的围攻。为了应对这一危机，洪秀全决定发起第二次西征，目标是会攻武汉以解救安庆。根据计划，陈玉成将从长江北岸进入湖北，攻打武昌北部；而李秀成则负责沿长江南岸经江西入湖北，进攻武昌西南部。两路人马原定于1861年4月在武汉会师。但实际上，由于英国的干涉以及南路军未能按时到达，陈玉成不得不提前撤回安庆。与此同时，尽管李秀成在6月份成功攻下了武昌，但由于得知陈玉成部队遭遇失利的消息，他也选择了撤军，放弃了原本的作战计划。
李秀成对西征的消极态度引起了其他将领们的不满和指责。许多人认为，正是由于他的撤退导致了武汉会师计划的失败，进而影响到了整个战役的结果。特别是当安庆最终失陷时，许多人都将责任归咎于李秀成的行为。9月份，李秀成重新调整部署，回师江西并进入浙江，最终在年底攻克了杭州。
随着陈玉成的牺牲，李秀成成为了太平天国中最具实力的地方领袖之一，掌控着苏南和浙江的大片区域。然而，这也引发了洪秀全的猜忌。为了削弱李秀成的力量，洪秀全开始广泛封赏李秀成手下的将领为王，试图通过分散权力的方式来限制他的影响力。面对这种情况，李秀成虽然采取了一些对抗措施，但很快外部的压力迫使他不得不将注意力重新集中在与清军的斗争上。
九、抗击英法
太平天国建立后，秉持“天下本一家，四海皆兄弟”的理念，对外国人采取了较为开放的态度。1853年春，当英国公使兼香港总督文咸访问天京时，太平天国向他正式通知，允许英国人来华经商，但警告不得再贩卖鸦片，并且不承认清朝与列强签订的不平等条约。然而，随着第二次鸦片战争的爆发以及《天津条约》和《北京条约》的签订，列强开始支持清政府共同对付太平天国。
1860年四月，李秀成领导的太平军攻克苏州后，决定进一步进军上海。当时，清政府官员吴煦和杨坊雇佣了美国冒险家华尔组建了一支名为“洋枪队”的武装力量，以保卫上海并试图夺回周边城市。面对这一挑战，李秀成于五月向在上海的英国全权大臣发出照会，声明收复松江、上海的重要性，并宣布太平天国对外实行平等互惠的通商政策。然而，英国方面对此置之不理。随后，洪仁玕也尝试通过外交途径与英、法、美领事沟通，但同样没有得到积极回应。
六月间，洋枪队进攻青浦，当地守军告急。李秀成迅速从苏州率部前往救援，在战斗中大败洋枪队，击毙数百名外国士兵，华尔本人也身负重伤。这场胜利不仅展示了太平军对抗外国势力的能力，还提升了士气。紧接着，李秀成再次向上海各国公使发出照会，表明即将进军上海并对外国侨民加以保护。然而，英法侵略者却下令用大炮和步枪轰击太平军，并调动黄浦江上的军舰进行支援。
1861年底，英国海军提督何伯和参赞巴夏礼试图利用太平军在长江上游战事失利的机会，提出平分中国并愿意协助推翻清朝的建议。这一提议遭到了太平天国的坚决拒绝，双方关系彻底破裂。次年（1862年），李秀成攻克杭州后，再度发起对上海的攻势。他在出征前发布了檄文，警告外国侵略者不要助纣为虐，否则将自取灭亡。
三月份，洋枪队连同华尔的常胜军以及其他外国军队联合清军，连续攻占了嘉定、青浦等地，并在上海周围建立了连绵不断的防线。面对如此强大的敌军，李秀成亲自率领精锐部队迎战。四月初五日，双方在太仓展开激战，太平军最终力破敌阵，法国海军提督卜罗德也在战斗中被击毙。随后，李秀成乘胜追击，将英法联军围困在嘉定城内。尽管敌人多次从上海派遣援军试图解围，但均被李秀成击败。最终，英法联军指挥官士迪佛立不得不焚烧嘉定城突围逃回上海。
克复嘉定之后，李秀成继续向青浦推进，将常胜军副统领法尔思德围困。华尔见势不妙，只好焚烧青浦后撤退至松江。李秀成紧追不舍，最终生擒法尔思德。此后，他又接连攻克泗泾、太仓、松江等据点，共摧毁敌营一百三十多座，将华尔及其部队困在松江城内。据李秀成回忆，当时的太平军已经让外国侵略者闻风丧胆，不敢轻易交锋。
正当太平军在上海战场取得一系列辉煌胜利之时，曾国荃率领的湘军却从安庆一路南下，仅用了两个月时间就占领了芜湖、巢县等多个战略要地，并直接威胁到了天京的安全。得知此消息后，洪秀全极为恐慌，一日之内连发三道诏书，命令李秀成立即撤兵回救天京。李秀成上奏解释说，虽然湘军正在围攻天京，但实际上兵力有限，无力实施有效封锁；而且天京周围的各个据点都在太平军手中，城内粮食充足，最佳策略是坚守待援，等到拿下上海后再购置火轮船和其他先进武器装备，然后全力解救天京。但是，洪秀全并未采纳他的建议，反而采用两面手法：一方面封李秀成为护国军师以示信任，另一方面直接下令皖南、皖北各地的太平军将领星夜兼程赶往南京增援。迫于压力，李秀成最终不得不从松江撤军返回天京。
十、中流砥柱
1862年五月，面对湘军从上游逼近天京的威胁，李秀成在苏州召开了一次重要的军事会议。在这次会议上，他与诸将详细分析了当前的形势，并提出了一系列战略建议。李秀成认为，湘军拥有水师的优势，可以以逸待劳，因此不宜与其正面交锋。相反，应该将苏省的米粮和军火等物资尽可能多地运回天京，做好长期守御的准备。他预计经过两年的时间，当敌人因久攻不下而士气低落时，再进行决战将更有胜算。然而，当李秀成将这一策略上奏给洪秀全时，却遭到了严厉的斥责，迫使他不得不放弃这一计划。
六月间，李秀成再次在苏州召集包括杨辅清、李世贤以及天京直属各路大员在内的高级将领举行会议，讨论如何调集兵力回救天京。此时，洪秀全实行的是“强本弱枝”的政策，导致李秀成在指挥上遇到了不少困难。为了强调团结一致的重要性，李秀成亲自为《会议辑略》作序，呼吁所有将士要“联万心而作一心”，共同应对危机。此外，为了消除洪秀全对他的猜疑，李秀成还将苏、浙两省的政权全部交给其他将领管理，并将自己的母亲和家眷送回天京作为人质。在返回天京之前，他还采取措施稳定后方，诱杀了太湖地区的枪船组织，确保当地秩序不受干扰。
八月中旬，李秀成率领大军从苏州出发，到达东坝集结。随后，他将部队分为两路，一路由秣陵关进攻，另一路由板桥、善桥向雨花台挺进。九月初三日，太平军发起了总攻令，战线长达五六十里，通过挖掘地道炸毁湘军围墙，最终冲入敌阵展开激烈的肉搏战。这场战役持续了四十四天，双方损失惨重，湘军减员三分之一，曾国荃本人也负伤。曾国藩在给朝廷的报告中称这是自太平天国起义以来最长时间的一次围攻。然而，由于当时正值江南地区爆发瘟疫，加上湘军有水师支持能够持续补给，而太平军则需陆运物资，使得他们在严冬来临时陷入了困境。最终，在十月间，各路军队因缺乏粮食和寒衣被迫撤退。
由于未能成功攻破清军营垒，李秀成被洪秀全革去了王爵。但他并未就此放弃，而是提出了一个新的“进北攻南”策略。根据这一计划，太平军将从长江北岸进攻湘军后方，迫使敌人调动南岸及下游的部队前往支援，从而达到解救天京的目的。十月间，李秀成的大军昼夜兼程渡过江浦、浦口，并接连攻克含山、巢县、和州等地。但就在此时，骆国忠在常熟叛变，迫使李秀成不得不暂时返回苏州平定内乱。直到1863年二月，他才重新回到巢县指挥作战。
按照新的计划，李秀成留下部分兵力牵制清军，自己则率主力部队打算经安徽舒城、六安、英山、霍山等地快速推进至湖北麻城，分兵攻打黄州和汉口，合围武昌，并进一步扩展至荆州、襄阳，与远征陕西的扶王陈德才部会合。然而，当大军抵达六安州时，正逢青黄不接时节，无法获得足够的粮食补给，不得不回撤。途中又遭遇寿州练匪苗沛霖的骚扰，加之洪水泛滥，几十万太平军在饥饿和自然灾害的双重打击下死伤惨重，最终只能退回天长一带。
据李秀成本人后来回忆，这次“进北攻南”的战略失败直接导致了十几万人的伤亡，同时由于他在雨花台战役之后没有及时返回苏南和浙江参与防御，使得这些地区的太平军不断溃败，苏州和江南的郡县相继失守，苏福省瓦解，浙江也陷入混乱之中。到了1863年底，李秀成被迫放弃了苏州，决定返回天京。侍王李世贤驻扎在溧阳，劝说他不要回京另谋出路，但李秀成拒绝了这一建议。李世贤甚至试图带兵前来阻止，但李秀成连夜轻骑赶回了天京。
回到天京后，李秀成向洪秀全提出了放弃京城、另寻他处的战略建议，指出目前天京已被重重包围，内部粮草不足，外部救援无望。然而，洪秀全坚决反对撤离，并威胁要革去李秀成的官职。洪秀全自信地宣称自己的江山如铁桶般坚固，即使没有李秀成的支持也能得到其他人的扶持。对此，李秀成感到非常愤怒，甚至表示宁愿被立即处决也不愿日后受刑。事后，洪秀全意识到自己的态度过于强硬，于是派人安抚李秀成，并继续让他负责天京的防守工作。
从那时起直到天京最终失陷，李秀成一直坚守在天京。他曾下令李世贤领军前往江西筹集粮食，计划在秋收后返回援救天京。
十一、忠贞殉国
1864年正月，太平天国的天保城失陷，天京被湘军彻底包围。此时，李秀成负责全城的防守工作。四月十九日，洪秀全病逝，为了稳定军心，李秀成在五日后扶立洪秀全长子洪天贵福（即幼天王）继位。然而，此时天京城内的军队只剩下了一万多名，其中能够作战的士兵仅有三四千人，而且粮草已经断绝。湘军对天京的围攻日益紧迫，他们从东门到北门沿城墙挖掘地道以图攻城。尽管如此，李秀成还是指挥守城部队连续破坏了几十处地道。
到了五月，地保城也落入敌手，湘军利用猛烈的炮火掩护，逼近太平门，并继续挖掘地道进行攻击。六月间，湘军终于通过炸塌城墙的方式冲入城内。面对突如其来的进攻，太平军一万多人与敌人展开了殊死搏斗，一部分战士战死沙场，其余则试图在混乱中突围。李秀成见势不妙，立即奔回朝门，将自己的战马让给了幼天王洪天贵福骑乘，并率领残部保护其逃往清凉山暂避。经过一番周折，洪天贵福得以逃脱追捕。而李秀成本人则换乘了一匹体力不佳的马，在初更时分假扮成清兵，试图从太平门缺口冲出。不幸的是，由于坐骑无法快速行进，他很快便与大队人马走散，流落到了方山一带。当地百姓曾试图帮助他脱险，但最终还是被八村村董陶大来发现并捉获，随后被交给了湘军将领萧孚泗。
李秀成被捕后，被送往曾国荃的军营。曾国荃因为自己的兄弟曾国华曾在三河镇战役中丧生于李秀成之手，因此对其怀有深仇大恨。他在审讯过程中摆列了刀、锥等刑具，意图将李秀成残忍地处决。据记载，曾国荃不仅命令手下用锥子刺伤李秀成的手臂和大腿，甚至亲自上阵施以酷刑，导致后者血流如注。即便如此，李秀成依然表现得异常坚强，他对曾国荃痛斥道：“曾九！各扶其主，你生什么气？且兴灭无常，今天偶然得逞，就发疯了吗？”这种坚毅的态度赢得了旁观者的敬佩。
在狱中，李秀成以惊人的毅力每天写下7000多字的自述，详细记录了自己的一生经历以及对太平天国运动的看法。这份《李秀成自述》长达数万字，但由于种种原因，原稿卷末第74页以后的内容部分被撕去，未能完整保存下来。据说，李鸿章在读完这部自述后也为之动容，称赞李秀成是“英雄人物”。然而，根据历史学家罗尔纲的研究，曾国藩可能出于邀功的目的而夸大或扭曲了一些史实，并担心清廷会对李秀成进行审讯，从而揭露不利于己方的信息，因此未经请示便擅自决定将其杀害。此外，还有一种说法认为，李秀成曾经试图效仿三国时期的姜维诈降，并劝说曾国藩称帝反清，但这只是后来流传的一种猜测，并没有确凿证据支持。
1864年8月7日，也就是太平天国甲子十四年六月二十五日，曾国藩派候补知府李鸿裔告知仍在撰写“天朝十误”等内容的李秀成，当天他将被处决。面对即将到来的死亡，李秀成表现得非常从容，他对李鸿裔表示：“中堂厚德，铭刻不忘；今世已误，来生愿图报。”傍晚时分，李秀成步赴刑场，谈笑自若，并诵读了十句绝命词，以此表达自己对太平天国事业的忠诚。随后，他英勇就义，享年四十二岁。
李秀成死后，曾国藩下令将其尸体装入棺木安葬，同时遵照清廷旨意，将他的头颅装在小木笼里，派人沿途展示给江南地区的民众观看，以此作为警示。
