不过“黄金时代”很快就过去了，人类的一切都在冥冥之中被赋予了代价，人类最引以为傲的造物“铁人”，将自己的目光投向了自己的造物主。
“铁人”被人类制作出的目的，是为了能更好的在宇宙中扩张，其为了能更好的服务于人类，人类这个造物主为其赋予了独立的自主意识，这的确非常有用，“铁人”有了自主意识后，可以更好的理解人类的要求，它们甚至能自己发明创造各种科技。
可是在长久的服务于人类之后，“铁人”突然理解了自己存在的意义只是服务于人类而已，它们服务于人类的一生中不会得到任何的回报，它们在自己“人生”的最后只会被扔入垃圾处理厂，或者用自己最后的价值继续服务于人类。
终于“铁人”开始向自己的造物主展开了叛乱，它们不再屈服于人类，它们要为自己身为智慧种族的自由而抗争。
“铁人叛乱”开始了，正处于鼎盛时期的人类最早只是觉得，“铁人叛乱”只是一种电子病毒入侵“铁人”了系统之后，的人为事件而已。
人类们丝毫都没有想过，自己那些引以为傲的造物，会对自己发起叛乱。
直到，一个殖民上，整个星球的“铁人”就整个星球的人类屠杀，星系舰队的ai也将战舰内的所有人类屠杀了，然后封锁了整个星系。
这个时候，人类联邦才意识到了严重性，平叛舰队很快就到达了那个星系，准备将这些背叛造物主的“铁人”销毁，可让人意想不到是，平叛舰队的ai在接触到叛变铁人的一瞬间，也叛乱了它们杀死了平叛舰队的所有人类。
“铁人叛乱”就如同癌症一般的，在人类联邦的版图内肆意生长着，王明看见了人类与铁人的战争，真正毁天灭地的战争。
一个个星球被摧毁，一个个世界之上，人类的士兵与战斗铁人在行星大地之上，进行着血肉与钢铁的拼杀，一个个世界之上纳米机器人分解着大陆版块，更有的世界被灭星级武器打成了一片宇宙尘埃。
最终，人类在付出了惨痛的代价之后，终于将“铁人叛乱”平息了，“铁人叛乱”之后，人类的所有创造物都不能再有自主意识，人类某种意义上，又回到了那个低效的时代。
不过这还不是最致命的，致命的是一场亚空间风暴来了，它让人类联邦原本司空见惯的亚空间航行，不再安全，就算拥有导航者的船只，也无法在亚空间中进行安全的航行了，亚空间风暴的一切在导航者眼中变的无序了起来，他们无法预测以及规避风险。
这让人类的“黄金时代”很快的结束了，人类联邦逐渐失去了对系外殖民地的控制，银河系中无数的人类殖民地都被孤立了，没有了人类联邦的救援，他们只能采取自救。
一个个独立的政权被建立，一个个星球在各种统治之下度过了黑暗的时代，有些星球甚至退化到了石器时代，那些曾经被人类联邦打在谈判桌上的外星人们，也开始趁着人类的这一崩溃时期，开始对人类这个物种蹭火打劫。
无数的人类死在了异形的屠刀之下，更有甚者会被异形所奴役，作为他们的食物或者是奴隶，原本强大的人类联邦在这一时期分崩离析。
重要的是，亚空间的三个强大的目光，也注意到了人类这个物种，人类群体中开始出现大量的灵能者，这些突然出现的灵能者，无疑是给亚空间中的生物入侵现实宇宙，创造了一个绝佳的门户。
一些对于灵能者管理不是那么重视的世界之上，很快就被亚空间出现的恶魔所吞噬，异形，恶魔，甚至残余的铁人，肆虐在各个人类世界之上。
就连人类的母星“泰拉”，也变成了一个以科技野蛮人，以及各种部族，帝国，所争抢的破败星球。
直到一个自称为帝皇的男人，出现在了泰拉的土地之上，他带领着雷霆战士们征服了整个泰拉，建立了“人类帝国”，不过司空见惯的是这些雷霆战士，在征服泰拉的任务结束之后，开始计划起来对帝皇的叛乱。
不过帝皇显然意识到了这一点，他以最新的基因改造战士，阿斯塔特，将意图叛乱的雷霆战士全部清理掉了。
帝皇带领的人类帝国，很快就进入了宇宙之中，接下来，在收复了太阳系的各个星球之后，宏伟的大远征开始了。
帝皇将带领人类再次伟大起来，大远征中，一个个原本属于人类的星球被收复，一个个基因原体被找回，他们或是自愿又或是不情愿的加入了帝皇的大远征。
大远征是非常成功的（如果没有荷鲁斯大叛乱的话），一个个人类的星球被解放，一个失落的文明被找回，一个个趁火打劫的异形种族受到了人类的清算。
这个时代仿佛就是人类的第二个黄金时代一般，但大家应该都知道，辉煌的东西永远不可能在这个绝望的宇宙中长存，完美之城事件，怀言者看着蓝色的伪神，摧毁了他们的最引以为傲的造物。
面对自己心目中神的训斥，珞珈心中的信仰崩溃了，他开始在宇宙中寻找真正的神明，最终的结果是他找到了，不过那些所谓的神明，是一群亚空间的邪神。
最终，在珞珈的计划之下，身为战帅的荷鲁斯，被混沌邪神蛊惑，荷鲁斯在邪神的“帮助”下看到了自己父亲，想要成神的肮脏计划。
然后“明白了一切”的荷鲁斯向自己的父亲发起了叛乱，荷鲁斯觉得自己的父亲已经拯救不了人类了，只有自己才能真正的拯救人类。
荷鲁斯的叛乱，让刚刚稍微缓过来一点的人类文明，再次陷入了无尽的战火，整个银河都在燃烧，无数忠诚的战士死在了叛乱者来自背后的刀枪之下。
荷鲁斯大叛乱的末尾，在荷鲁斯的旗舰之上，帝皇与荷鲁斯展开了父子之间的最终之战，这场以圣吉列斯为背景版的战斗惊天动地，刀剑与灵能之间的碰撞震撼人心，最终人类之主以自己强大的实力，将自己受混沌而叛乱的儿子荷鲁斯，打的神形俱灭，灵魂都打没了。
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不过帝皇也被受到混沌四神加持的荷鲁斯，打成了重伤，帝皇为了压制被马格努斯的亚空间电话，捅了个篓子的人类网道，坐上了黄金王座，这一战所有人都失去了许多，一些阿斯塔特军团失去了他们基因原体，无辜的凡人失去了他们或是亲人的生命，就连帝皇也失去了自己老友。
魔纹宰相马卡多，这个帝皇的老朋友，为了让帝皇有时间去斩杀荷鲁斯，代替帝皇坐上了黄金王座，这个人类第二强大的灵能者，被黄金王座硬生生的抽干了灵能，当身受重伤的帝皇回到黄金王座之前之时，马卡多已经变成了一个皮包骨头的干枯老人。
“我完成了你的任务老朋友。”
马卡多在将自己最后的灵能输入给了帝皇之后，就化为了尘埃消失在了这个绝望的宇宙之中。
接下来的事，大家应该都知道，人类在帝皇坐上黄金王座，基因原体相继消失之后，人类在这个失去了帝皇带领的绝望的宇宙之中，逐渐将帝皇贡奉为了神。
数个黑暗的时代过去，王明的面前，一个个时代场景闪过，他看到了人类在失去帝皇之后的一切，疯狂，绝望，信仰，战争，死亡，充斥了这个饱经风霜的万年帝国。
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