在打败了地下通道中的狼形怪物后，大雄他们和侦查小队继续沿着通道深入。
通道内弥漫着一种压抑的气氛，墙壁上时不时闪烁着诡异的光芒，仿佛在诉说着古老的秘密。
“这里感觉越来越阴森了，大家要小心。”静香有些害怕地说道。
“别怕，静香，有我们在呢。”大雄安慰道。
胖虎则在一旁紧握拳头，“哼，不管有什么危险，我们都能克服，一定要找到那个实验室。”
哆啦A梦一边用探测器扫描周围，一边说：“大家注意，探测器显示这里的能量波动很不稳定，可能还有其他未知的危险。”
他们走着走着，来到了一个岔路口，三条通道分别通向不同的方向，每条通道都散发着神秘的气息。
“我们该走哪条路呢？”侦查小队队长问道。
“我来看看。”哆啦A梦拿出一个方向探测仪，经过一番操作后，皱着眉头说：“奇怪，探测仪受到了干扰，无法准确判断哪条路是正确的。”
“那我们只能分头行动了。”真嗣说道。
“不行，这样太危险了，我们不能分散。”大雄反对道。
就在大家犹豫不决的时候，他们听到从中间的通道传来一阵微弱的嗡嗡声，声音中似乎夹杂着一些类似机械运转的声音。
“我们走中间这条试试吧，说不定有线索。”渚薰提议。
大家点头同意，朝着中间的通道前进。随着他们的深入，通道越来越宽阔，周围出现了一些巨大的齿轮和机械装置，这些装置看起来已经有些陈旧，但仍然在运转着。
“这些机械装置是做什么用的呢？”胖虎好奇地看着周围。
“不知道，但感觉它们和我们要找的实验室有某种联系。”哆啦A梦回答道。
突然，机械装置开始加速运转，发出巨大的轰鸣声，齿轮之间摩擦出耀眼的火花。
“不好，大家小心！”大雄喊道。
话音未落，一些巨大的金属臂从机械装置中伸了出来，朝着他们挥舞过来。
“快躲开！”静香惊叫道。
驾驶员们操控着EVA机体躲避金属臂的攻击，同时寻找反击的机会。
“我们得想办法破坏这些机械装置，不然我们会一直被攻击。”真嗣说道。
“我发现了，这些机械装置的核心动力源在那边。”哆啦A梦指着一个被层层防护包裹着的发光球体说道。
“那我们集中攻击那个动力源！”大雄喊道。
众人朝着动力源发动攻击，然而，防护层非常坚固，他们的攻击只能在防护层上留下一些浅浅的痕迹。
“这样不行，我们的攻击太分散了，得一起攻击一个点。”渚薰说道。
于是，驾驶员们调整攻击方向，集中火力攻击防护层的一个点。在连续的攻击下，防护层终于出现了一个小缺口。
“继续攻击，扩大缺口！”胖虎喊道。
经过大家的努力，缺口越来越大，动力源开始出现不稳定的迹象。
“再加把劲，它快不行了！”静香喊道。
最终，动力源在一阵耀眼的光芒中爆炸，周围的机械装置也随之停止了运转。
“呼，终于搞定了。”胖虎松了一口气。
“我们继续前进吧，应该离实验室不远了。”大雄说道。
他们继续沿着通道前进，不久后，前方出现了一道巨大的金属门，门上刻满了各种神秘的符号和图案，和之前他们见过的符号相似。
“这里应该就是实验室的入口了。”哆啦A梦说道。
“可是这门怎么打开呢？”静香看着巨大的金属门问道。
大家在门周围寻找开门的方法，这时，大雄发现门旁边有一个类似控制台的装置，上面有一些凹槽，凹槽的形状和他们在神秘身影那里发现的武器形状相似。
“你们看，这个会不会是开门的机关？”大雄说道。
“有可能，我们试试把那些武器放上去。”哆啦A梦回答道。
他们把之前缴获的神秘身影的武器插入凹槽，金属门发出一阵低沉的轰鸣声，缓缓打开。
门内是一个巨大的空间，里面摆满了各种先进的仪器和巨大的容器，和大雄在与EVA机体深度融合时看到的画面一模一样。
“我们终于找到了。”胖虎兴奋地说。
“这里就是一切的源头吗？”真嗣看着周围，满脸震惊。
此时，明日香看着周围的仪器，对绫波丽说：“哼，这些奇怪的东西，看起来就不是什么好东西，肯定是它们搞出了那些使徒。”
绫波丽微微点头：“嗯，我们得仔细找找线索。”
他们在实验室里四处查看，发现了一些实验记录和文件，文件中记载了一个可怕的计划。原来，使徒是这个实验室早期的实验产物，目的是为了创造出一种超越人类的新生命形式，但实验失控，使徒开始拥有了自己的意识，并对人类产生了威胁。而那些神秘身影则是实验室的守护者，他们试图阻止人类对使徒的研究，认为这是对自然秩序的破坏。
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“这……这太可怕了，这个计划竟然引发了这么大的灾难。”静香颤抖着声音说道。
“我们得把这些文件带回去，让司令看看。”大雄说道。
就在他们准备收集文件的时候，实验室里突然响起了警报声，灯光开始闪烁。
“不好，我们触发了警报，可能有危险。”哆啦A梦说道。
突然，从实验室的深处涌出一群小型的机械怪物，这些怪物外形像蜘蛛，行动迅速，朝着他们扑了过来。
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