接下来的几天，崇祯每日都宣吴有性进宫为他诊治。吴有性是太医院新进的年轻太医，他的医术和为人都让崇祯颇为赏识。然而，崇祯并非全然信任吴有性，他想知道这个年轻太医是否可靠，背后又是谁的人。
崇祯刻意在吴有性面前表现得十分轻浮，一边让他诊脉，一边调戏身旁的宫女翠儿。崇祯暗中观察着吴有性的反应，只见他满脸困惑和反感，似乎完全不赞同皇帝此等行径。吴有性的表现让崇祯心中一喜，看来此人的确不是魏忠贤一党，而是个正直不阿之人。
天启十二月二日，皇帝所患的“天花”终于痊愈。这一日，崇祯将吴有性召入文华殿，吩咐太监将殿内门窗紧闭，遣散所有人，只留他二人在殿中。吴有性对皇帝的举动十分不解，却只得遵旨。
“吴爱卿，你可确信朕得的是'天花'?“崇祯压低声音问道。
吴有性恭敬地答道:“陛下，臣在民间见过天花患者，他们的症状与陛下的确如出一辙。”
崇祯又问:“可你不觉得朕的病症十分轻微吗?”
“陛下，臣心中也疑惑，想必是陛下龙体健硕，上天庇佑，才让病症如此轻微。”吴有性如实回答。
崇祯满意地点点头，接着说道:“吴爱卿，你可知'人痘'一法?”
吴有性答道:“'人痘'是将天花痘痂制粉，吹入鼻中，使人得一轻症，痊愈后便不会再染天花。但此法仍有风险，时有因人痘而丧命者，故民间并未推广。”
“不错。”崇祯称赞道，“你的确学识渊博。但朕要说的是，上天启示了朕一个法子，可使'种痘'之事变得更加安全可靠，而朕已亲身试验，果然奏效。”
吴有性闻言大惊，震惊于皇帝竟会以身犯险，更惊于所谓“安全种痘“竟有可能。
崇祯看出他的震惊，便将手臂伸到他面前。只见皇帝手臂上有几个淡淡的疤痕。“吴爱卿，可知'牛痘'?”
“牛痘?”吴有性不解。
“不错。“崇祯点头道，“牛也会得一种'牛天花'，人若被染上牛痘，只会出现轻微症状。而人痘愈后，竟对天花也就免疫了。这个疤，便是朕取牛痘脓液，点于手臂伤口所致。”
吴有性听得目瞪口呆，简直不敢相信皇帝所言。若果真如此，岂不是从此天花可防?然而这等惊世之语，竟出自圣上之口，实在令人匪夷所思。
吴有性听完崇祯的话，震惊之余也充满了疑问。他急切地问道:“陛下，这'牛痘'之法，您是如何发现的?若果真如陛下所言，这简直就是万民之福，我们理应尽快将其推广至民间，让百姓们免受天花的侵扰。”
崇祯心中暗想，这牛痘接种法在历史上本该是几十年后英国医生爱德华·詹纳的发明。但自己作为一个穿越者，自是不能将真相告知吴有性。
于是他神秘地说道:“吴爱卿，这牛痘之法乃是上天通过梦境启示于朕的。朕需要你替朕实验，以证明这个方法的可行性。”
其实，崇祯心中另有盘算。他并不打算将牛痘接种的方法完全推广到民间，而是想将其变为自己的秘密武器。一旦关键时刻，他就可以用此巩固自己的权力。
吴有性闻言，立即跪倒在地，恭敬地说道:“陛下英明，臣愿为陛下分忧，为天下百姓解难。”
崇祯满意地点了点头，接着吩咐道:“吴爱卿，朕的翊坤宫中恰好有几头染了牛痘的病牛，你可以用来实验。朕择日就会升你的官职，以表彰你治愈朕'天花'一事。你要谨记，这牛痘接种之法需得悄悄进行，不可声张。”
次日天启七年十二月三日，崇祯表彰吴有性治愈了自己的“天花“，并将其升为太医院院判的旨意传到了太医院。
太医院院使李太医对吴有性的态度较之前大为改观。他笑容可掬地对吴有性说道:“吴太医，恭喜你治愈了皇上的'天花'，得到圣上赏识，前程似锦啊。”
吴有性谦虚地回答:“李太医，这不过是我的运气罢了，何德何能，当不起您的夸奖。”
李太医突然将一个小盘推到吴有性面前，示意他揭开盘中的红布。吴有性照做，只见布下赫然是几锭金灿灿的金子，光芒耀眼。
吴有性大惊，连忙问道:“李太医，这是何意?据我所知，陛下并未下旨赏赐微臣黄金。”
李太医笑而不语，过了片刻才说:“吴太医，这金子是我送给你的。你想想，当初是我指派你去给皇上看'天花'，这等凶险的差事，你替我，替咱太医院的同仁们冒了多大的风险啊。你立下如此大功，岂能不得些许实惠?”
吴有性仔细端详面前的金锭，足有五十两之多。他心知以李太医的家底，拿出这些金子绝非易事，所以这其中必有蹊跷。
他望着面前的金锭，心中五味杂陈。这笔巨款来路不明，本不该收。但转念一想，若想完成崇祯交付的秘密实验，没有雄厚的资金支持，又如何招募到足够的志愿者?
经过一番天人交战，吴有性还是咬咬牙，将金子揣进了怀中。“陛下啊陛下，交给臣如此重任，却只赐了个区区院判之职，未免有些吝啬啊。”
他在心中暗暗抱怨。
见吴有性收下金锭，李太医笑眯眯地说:“吴太医，日后若是再给皇上看病，只要方便，还请多跟我通个气，莫要见外啊。”
在古代中国，皇帝的健康状况向来是一桩机密大事。因为这直接关系到皇权的稳固与否。就拿不久前的天启皇帝来说，他猝然病重的消息没能及时传到魏忠贤的耳中，以致魏忠贤在天启将皇位传给崇祯时毫无准备。如今崇祯登基，魏忠贤自然要设法弥补这个缺漏，把自己的耳目安插进太医院里。
李太医的话如一块巨石，沉甸甸地压在吴有性心头。他一时不知如何是好。
李太医见吴有性踌躇不决，又补充道:“吴太医，你不必多虑。虽说你官职有了长进，但我终究是太医院的主官。我肩负着保驾皇上龙体康泰的重任，你若与我分享圣上的病情，也并非僭越，更谈不上什么禁忌。”
这番话听似柔软，实则寒芒暗藏。李太医分明是在逼迫吴有性与他站在同一战线上。
“陛下啊，这可如何是好?看来我只能见招拆招，随机应变了。”吴有性在心中默默哀叹。
他不动声色，谦恭地回答:“李院使教训得是。皇上的诊治本就事关重大，我岂敢独断专行。日后但凡遇到棘手之症，我必当及时禀告院使大人，请您拿主意。”
“如此甚好。吴太医能有此觉悟，我很欣慰。“李太医满意地点点头，“往后咱们还要齐心协力，为皇上的龙体保驾护航。有什么需要帮衬的，尽管开口。”
“多谢院使栽培，晚生感激不尽。”吴有性躬身作揖回复说道
但是他心中却是五味杂陈。
“我究竟该效忠于谁?是皇上，还是太医院?抑或是我行医的初心?”吴有性长吁短叹，陷入了沉思。
