他们继续前往其他能量漩涡地点，重复着之前的操作。在这个过程中，他们发现这些能量漩涡似乎是按照某种特定的规律分布的，像是在构建一个巨大的能量网络。
“这些能量漩涡可能是一个更大阴谋的一部分，我们得尽快搞清楚。”大雄说道。
当他们解决完所有的能量漩涡后，回到总部，却发现之前被关押的神秘身影已经消失不见，只留下了一些奇怪的符号在审讯室的墙壁上。
“这是怎么回事？他们怎么逃走的？”胖虎气愤地说。
“这些符号是什么意思？”静香看着墙壁上的符号问道。
哆啦A梦仔细观察着符号，然后从四次元口袋里拿出一个符号解读器。经过分析，解读器显示这些符号是一种古老的密码，和之前加密文件中的部分内容相似。
“看来这些神秘身影是想给我们传递某种信息，或者是在嘲笑我们。”哆啦A梦说道。
“不管是哪种情况，我们不能被他们牵着鼻子走，我们要加快破解加密文件的进度，找出他们背后的秘密。”大雄坚定地说。
在大家努力破解加密文件的同时，大雄又一次尝试和EVA机体进行深度融合，希望能从之前看到的模糊画面中找到更多线索。在融合过程中，那些画面变得更加清晰，他看到了那个巨大实验室里有一些穿着白大褂的人在操作着仪器，还有一些巨大的容器，容器里似乎装着和使徒类似的生物。
融合结束后，大雄立刻把他看到的情况告诉了大家。
“这听起来像是一个实验基地，难道使徒是从那里制造出来的？”胖虎惊讶地说。
“有这种可能，而且那些神秘身影可能也和这个实验基地有关。”哆啦A梦说道。
“我们得找到这个实验室的位置，也许那里有我们想要的答案。”静香说道。
他们把这个新发现告诉了碇司令，碇司令决定派出侦查小队，利用大雄提供的画面信息在城市周边进行搜索。
在搜索过程中，他们发现了一些废弃的地下通道，这些通道的结构和大雄看到的实验室周围环境有些相似。
“这里可能有线索，我们进去看看。”侦查小队队长说道。
他们小心翼翼地沿着地下通道前进，通道里弥漫着一股神秘的气息，墙壁上有一些奇怪的标记，和之前神秘身影留下的符号有几分相似。
“大家小心，这里可能有危险。”队长提醒道。
突然，前方传来一阵低沉的咆哮声，仿佛有什么巨大的生物在靠近。
“准备战斗！”队长喊道。
众人紧张地注视着前方，只见一个巨大的、外形像狼但又有着金属外壳的怪物出现在他们眼前。怪物的眼睛闪烁着绿色的光芒，口中露出锋利的獠牙。
“这是什么东西？”一名队员惊恐地说。
“不管是什么，先攻击！”队长下令。
他们朝着怪物发动攻击，但怪物的速度极快，轻松地避开了他们的攻击，并且朝着他们扑了过来。
“啊！”一名队员被怪物击中，倒在了地上。
“快救他！”队长喊道。
就在这时，大雄他们驾驶着EVA机体赶到了。
“大家别怕，我们来了！”大雄喊道，操控EVA机体朝着怪物冲去。
怪物看到EVA机体，并没有退缩，反而更加凶猛，它朝着大雄的EVA机体扑了上来，用锋利的爪子进行攻击。
“这家伙好强！”大雄一边躲避一边说道。
“我们一起上，围攻它！”哆啦A梦说道。
于是，驾驶员们一起围攻怪物，在战斗中，他们发现怪物的金属外壳非常坚硬，普通的攻击很难对它造成伤害。
“攻击它的眼睛，那里可能是弱点！”渚薰喊道。
大家调整攻击方向，朝着怪物的眼睛发动攻击。怪物吃痛，发出一阵愤怒的咆哮，但它的攻击也变得更加疯狂。
“它发狂了，大家小心！”静香喊道。
在激烈的战斗中，胖虎找到了一个破绽，他操控EVA机体朝着怪物的腹部狠狠地刺了一刀。怪物受到重创，行动开始变得迟缓。
“好机会，继续攻击！”大雄喊道。
众人抓住机会，集中火力攻击怪物，最终，怪物在一阵猛烈的攻击下倒下了。
“大家没事吧？”大雄问道。
“我们没事，不过这怪物到底是什么？”侦查小队队长问道。
“不清楚，但肯定和我们正在调查的事情有关。”哆啦A梦说道。
他们继续沿着地下通道前进，希望能找到那个神秘实验室的入口，而在通道的深处，似乎有一股更加强大的力量在等待着他们，这股力量将把他们带入一个更加惊人的真相之中。
